100701藥物化學（001化學制藥部、009上海市抗感染藥物重點實驗室、010化學制藥新技術中心、006生物制藥部、012張江分院）
《有機化學》：王積濤主編，南開大學出版社，2003第二版
《基礎有機化學》（上、下）：邢其毅、裴偉偉、徐瑞秋、裴堅主編。“十五”國家級規劃教材高等教育出版社，2005年6月第三版
《藥物化學》：尤啟東主編，化學工業出版社，2004第一版
《高等藥物化學》周偉澄主編化學工業出版社2006年第一版
《分析化學》，孫毓慶，胡育筑主編，科學出版社，2006年第二版
《有機化合物光譜解析學》：姚新生主編，人民衛生出版社
100702藥劑學（003藥物制劑國家工程研究中心）：
《分析化學》：李發美主編，人民衛生出版社，第五版
《物理化學》：候新樸主編，高等醫學院校藥學類教材，人民衛生出版社
《物理化學簡明教程》：印永嘉等編，高等教育出版社
《藥劑學》：崔福德主編，人民衛生出版社,2003年第五版
《生物藥劑學與藥物動力學》：梁文權主編，人民衛生出版社,2004年第二版
100703生藥學（004中藥研究部、012張江分院）：
《天然藥物化學》：吳立軍主編，人民衛生出版社，第五版
《分析化學》：李發美主編，人民衛生出版社，第六版
《有機化合物結構鑒定與有機波譜學》：寧永城，科學出版社，2004年第二版
100704藥物分析學（005分析測試中心）：
《基礎有機化學》（上、下）：邢其毅、裴偉偉、徐瑞秋、裴堅主編。“十五”國家級規劃教材 高等教育出版社，2005年6月第三版
《分析化學》，孫毓慶，胡育筑主編，科學出版社，2006年第二版
100705微生物與生化藥學（006生物制藥部、012張江分院）：
《微生物學》：沈萍主編，高等教育出版社，2000年7月第一版
《生物化學》：王鏡巖、朱圣庚等編，高等教育出版社，2002年7月第三版
100706藥理學（007藥理評價研究中心、008國家（上海）新藥安全評價研究中心、011中國醫藥工業信息中心、015臨床藥學研究中心）：
《生物化學》：查錫良主編，全國高等學校教材，供基礎、臨床、預防、口腔醫學類專業用，人民衛生出版社，第7版
《藥理學》：楊寶峰主編，全國高等學校教材，供基礎、臨床、預防、口腔醫學類專業用， 人民衛生出版社，第7版
《毒理學基礎》：王心如主編，人民衛生出版社第五版
《管理學》[美]斯蒂芬.P.羅賓斯等著，孫健敏等譯，中國人民大學出版社，第九版，2008年12月
《醫藥管理學》邱家學主編，中國醫藥科技出版社2012年6月
《藥事管理與法規》主編國家食品藥品監督管理局執業藥師資格認證中心，中國醫藥科技出版社2008年3月第1版
081703生物化工（006生物制藥部）
《微生物學》：沈萍主編，高等教育出版社，2000年7月第一版
《生物化學》：王鏡巖、朱圣庚等編，高等教育出版社，2002年7月第三版
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